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    擔心NGS文庫構建樣本量不夠?小達君幫您輕松搞定!

    作者:admin 信息來(lái)源:達科為 日期:20190610 打印 字體:  
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    “Biu! Biu! Biu!

    想要文章高大上,基因測序來(lái)幫忙!

    文庫構建難,難!難?

    選對試劑,一切都不是事兒!”

    小達君暖心推薦Diagenode低樣本量文庫構建試劑盒,讓小樣本量的基因測序也成為可能!下面,我們就來(lái)看看這款試劑盒到底有多優(yōu)秀吧。

     

    The MicroPlex Library PreparationTM Kit v2


    ? 單管操作,只需3步,2小時(shí)完成;

    ? Input只需pg級別;

    ? 減少潛在的bias——更少的PCR擴增反應;

    ? 高靈敏度的ChIP-seq——PCR重復率低;

    高通量的靈活性,含有48 barcodes(8 nt);

    ? 可自動(dòng)化操作

     簡(jiǎn)單快速的操作流程


    Fig.1 比較MicroPlex kit和Illumina? TruSeq? kit構建文庫的操作流程

    MicroPlex ki只需要一次純化,三步即可完成。而Illumina?的工作流程需要純化多次,經(jīng)過(guò)5步才能完成。

     

    只需少量起始樣本量—— 50pg DNA


    Fig.2 片段化的dsDNA, input范圍從50pg至50ng,通過(guò)快速簡(jiǎn)單的3-step protocol,在Illumina?NGS平臺制備測序文庫。擴增純化后的文庫用于測序。Kit里面的indexing試劑,可在每條測序通道進(jìn)行12個(gè)樣本的測序。

     

    從少量起始樣本中獲得高品質(zhì)的測序數據


    Fig.3  對ChIP-seq富集產(chǎn)物的可靠檢測,并與ChIP-seq參考數據完美匹配。

    A、用Diagenode的H3K4me3抗體、True MicroChIP Kit進(jìn)行ChIP實(shí)驗,10000個(gè)細胞中ChIP下來(lái)17pg DNA,對照組35pg DNA。IP下來(lái)的DNA用MicroPlex Library Preparation Kit擴增并被轉化為可用于Illumina?平臺測序的文庫,通過(guò)IlluminaR Genome Analyzer分析文庫,根據說(shuō)明書(shū)進(jìn)行簇生成和測序。

    B、觀(guān)察到前40%的ChIP peaks與參考dataset間完美匹配?;贜IH Encode項目規范,如果前40%的peaks與對比dataset有至少80%的重疊比例,ChIP-seq 的結果被認為是original 和reproduced dataset間有重合性。

     品牌簡(jiǎn)介

    Diagenode公司2003年成立于比利時(shí),是世界上生產(chǎn)表觀(guān)遺傳學(xué)產(chǎn)品的知名公司。其產(chǎn)品包括聲波破碎機(Bioruptor?),自動(dòng)化系統(IP-Star?),染色質(zhì)免疫沉淀反應(ChIP)和DNA甲基化分析,高質(zhì)量的抗體,是表觀(guān)遺傳學(xué)、生物樣本制備和診斷的完整表觀(guān)遺傳學(xué)解決方案的領(lǐng)先供應商。

    產(chǎn)品信息

    產(chǎn)品貨號

    產(chǎn)品名稱(chēng)

    規格

    品牌

    C05010012

    MicroPlex Library Preparation kit v2 x12 (12 indices)  

    12 rxns

    Diagenode

    C05010013

    MicroPlex Library Preparation kit v2 x 48 (12 indices)  

    48 rxns

    C05010014

    MicroPlex Library Preparation kit v2 x 48 (48 indices)  

    48 rxns

    C01010131

    True MicroChIP & MicroPlex Library Preparation Package  

    16 ChIP rxns and 12 library prep rxns


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