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    【流式學(xué)習】10分鐘梳理流式染色中固定的常見(jiàn)問(wèn)題

    作者:admin 信息來(lái)源:達科為 日期:20190821 打印 字體:  
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    固定是為了保持組織/細胞和活的時(shí)候狀態(tài)一致,在組織學(xué)研究中經(jīng)常會(huì )用到。在流式染色中,有的時(shí)候也會(huì )用到固定,今天就和大家來(lái)聊聊流式實(shí)驗中固定相關(guān)的一些常見(jiàn)問(wèn)題。
    1. 流式實(shí)驗中,哪些情況下需要對細胞進(jìn)行固定處理?
    • 檢測細胞內指標
    我們在流式胞內實(shí)驗時(shí),比如檢測細胞因子(如IFN-γ)或者核內轉錄因子(如Foxp3)的時(shí)候,在樣本染完表面指標后,一般需要先進(jìn)行固定(或者固定破膜一起),然后再進(jìn)行破膜(打孔)以及后續的胞內指標染色操作。
    • 延長(cháng)樣本的保存,獲得充足的上機時(shí)間。
    最常見(jiàn)的情況是染色處理完已經(jīng)到很晚,平臺老師已經(jīng)下班或者自己的身體已經(jīng)扛不住通宵做實(shí)驗了,這個(gè)時(shí)候需要對樣本進(jìn)行固定處理,放到第二天檢測,這里的固是定為了保持檢測指標的穩定性;另一方面,當樣本特別多的時(shí)候,第一管樣本和最后一管樣本的時(shí)間間隔會(huì )很久,這種情況下考慮上機前做一下固定,保持前后數據的一致性,比如CD11b這個(gè)指標在白細胞中的表達會(huì )隨著(zhù)樣本放置時(shí)間的增加而上調。

    • 生物安全性考慮
    做流式的同學(xué)們都知道,流式檢測的樣本多種多樣,有可能我們接觸的樣本是疾病相關(guān)的,有的時(shí)候甚至是傳染病相關(guān)的。比如臨床檢測的樣本有可能來(lái)自于HIV病人,在這種特殊的情況下,我們希望能夠對樣本做固定處理或者是預固定處理,這樣會(huì )大大增加操作人員的安全性。
    • 對蛋白翻譯后修飾的檢測

    在蛋白翻譯后修飾(磷酸化、乙?;?、甲基化等)的研究過(guò)程中,固定劑不僅可以有效的“固定”住翻譯后修飾的位點(diǎn)(絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸等),也可以防止目標位點(diǎn)在活細胞中很快降解(比如磷酸酶會(huì )去除磷酸化修飾、去甲基化酶會(huì )移除甲基化修飾等)。下面的例子是用IL-6的重組蛋白刺激人外周血15分鐘后看STAT3705位酪氨酸的磷酸化水平,在刺激完樣本后就需要通過(guò)固定來(lái)實(shí)現目的氨基酸磷酸化水平“停留”在IL-6刺激15分鐘這個(gè)節點(diǎn)上。


    左圖:未用IL-6刺激,細胞固定后染色;右圖:用IL-6刺激15分鐘,細胞固定后染色。
    2. 常用的固定劑有哪些?
    • 脫水劑類(lèi)(如乙醇、甲醇)
    可以溶解脂類(lèi)物質(zhì),使細胞脫水,使蛋白沉淀到細胞結構上,后續染細胞內指標不需要額外的破膜步驟;這類(lèi)固定劑會(huì )使蛋白質(zhì)的三維結構發(fā)生變化,很容易造成抗體識別的表位發(fā)生改變,從而影響一部分抗體的染色效果。
    • 交聯(lián)劑類(lèi)(如甲醛、戊二醛)
    通過(guò)自由氨基基團把分子橋連起來(lái),從而能夠保持大多數目標蛋白/抗原構象的完整性;但也會(huì )使識別某些氨基酸殘基的抗體不能與這些基團結合,所以后續胞內指標的染色除了需要先用破膜試劑進(jìn)行打孔外,染色的過(guò)程也需要在破膜劑中進(jìn)行。此類(lèi)固定劑中最常見(jiàn)的是4%多聚甲醛溶液,其有效成分實(shí)際上就是甲醛。
    3. 流式實(shí)驗中固定會(huì )遇到的問(wèn)題及應對建議?

    理想的固定劑能使抗原固定,同時(shí)保持細胞、亞細胞結構的真實(shí)性,同時(shí)能夠保證抗體與所有細胞及亞細胞結構內抗原的充分接觸。但“理想很豐滿(mǎn),現實(shí)很骨干”,固定的過(guò)程或多或少對流式檢測帶來(lái)一些影響,只有了解了固定對流式染色帶來(lái)的影響我們才能更好的做好流式實(shí)驗。

    • 固定對熒光染料的影響是什么?

    主要表現在固定劑對串聯(lián)染料(tandem-dye,如APC/Cy7、PE/Cy7等)的影響:一個(gè)是固定劑有可能造成串聯(lián)染料的斷裂,比如APC-Cy74%多聚甲醛溶液接觸時(shí)間超過(guò)4個(gè)小時(shí)染料就有可能斷裂,所以如果細胞直接重懸在固定液里面建議盡快上機,如果要放到第二天上機,需離心去除固定液后重懸在流式染色液或者是PBS里面,當然有一些新的串聯(lián)熒光素可以有效減少這種情況,比如BioLegendAPC/Fire750TM染料。

    另外一個(gè)是固定劑有可能造成串聯(lián)染料的熒光“溢漏(spillover)”增加,對于這類(lèi)情況的建議是配色允許的情況下減少串聯(lián)染料的使用(但實(shí)際上很多多色panel來(lái)說(shuō),這都不算是一個(gè)解決方案);另外,使用一些商業(yè)化的固定buffer,也有可以在一定程度上減少熒光“溢漏”,如下圖所示:


    • 4%多聚甲醛溶液固定后的樣本可以保存多久?

    一般建議不要超過(guò)24個(gè)小時(shí),固定后的樣本放置時(shí)間越久,背景信號會(huì )越高,即使固定后的細胞重懸在不含固定劑成分的緩沖液中也會(huì )造成背景升高(我們建議固定后的樣本離心除去固定劑,重懸在流式染色緩沖液或者PBS里面)。

    如果需要長(cháng)時(shí)間保存樣本,建議在樣本做完表面染色和固定后,保存在專(zhuān)門(mén)的保存緩沖液中。但即便是有專(zhuān)門(mén)的保存buffer,對于用了串聯(lián)染料(如APC/Cy7、PE/Cy7等)染色的樣本,我們還是建議不要長(cháng)時(shí)間保存,很難避免補償的“漂移(shift)”。


    左圖:human PBMC刺激完當天染色后上機檢測;右圖:同一樣本,表染和固定后,保存在Cyto-Last? buffer里面,14天后做胞內染色并上機。

    • Ki-67染色時(shí),選擇哪種固定方式?

    流式在檢測一些特殊的核內指標時(shí),一般都會(huì )有推薦的固定破膜方案。比如在Ki-67染色一般會(huì )推薦用70%的冰乙醇作為固定劑(含打孔作用),如前文提到的脫水劑類(lèi)固定劑對蛋白空構象的影響大,在單染Ki-67的時(shí)候,乙醇的固定方式是完全沒(méi)有問(wèn)題的,但是在和其它指標共染時(shí),就需要考慮乙醇固定的方式和其它抗體兼容性的問(wèn)題,比如CD38 (Clone: HIT2)的抗體是明確不能和乙醇固定的方式兼容,而CD34 (Clone: 581)很大程度上可以兼容這種固定方式。醇類(lèi)和其它抗體(Clone)的兼容性很難一一驗證,所以在做Ki-67染色的時(shí)候我們也會(huì )用FOXP3的固定/破膜方式來(lái)替代乙醇的方案,而且大多數時(shí)候是可以獲得不錯的染色結果。


    BioLegend FOXP3 Buffer set對細胞進(jìn)行固定破膜處理后,染Ki-67抗體,左圖:小鼠淋巴結樣本;右圖:小鼠脾臟樣本。

    • 對于需要先固定再染色的樣本,注意點(diǎn)在哪里?

    流式實(shí)驗中,有一些情況我們希望或需要對樣本進(jìn)行預先固定處理,比如前文說(shuō)過(guò)的傳染病人的樣本或者是需要檢測蛋白翻譯后修飾的樣本。對于需要預固定的樣本,首先需要考慮預先固定處理對檢測指標的影響,有很多指標先染色再固定和先固定再染色出來(lái)結果差異非常大,導致這些差異原因和指標的類(lèi)型、抗體的克隆號等因素都有關(guān)系。


    如果我們的流式實(shí)驗要求對樣本進(jìn)行預先固定的處理,那實(shí)際上這就需要提前去驗證染色方案里所選的克隆是否適用于先固定后染色,這也有一定工作量。推薦大家參考借鑒BioLegend關(guān)于固定的專(zhuān)題,里面有做了很多克隆能否適用于先固定后染色的驗證。

    對比信息請參考:www.biolegend.com/fixation

    • 樣本需要先固定再染色,但方案里的一些指標不兼容預先固定,該怎么辦?

    這個(gè)問(wèn)題其實(shí)相當棘手,因為據我們了解的情況,目前市面上還沒(méi)有一個(gè)試劑生產(chǎn)廠(chǎng)家有這樣“完美”固定試劑可以先固定樣本而不對后續染色產(chǎn)生任何影響,如果有的話(huà),那我們今天所說(shuō)的關(guān)于固定的問(wèn)題,都不算是問(wèn)題。

    在實(shí)際遇到預固定和指標不兼容時(shí),我們會(huì )做如下建議:(1)使用替代指標來(lái)更換那些受固定影響的指標;(2)如果沒(méi)有可以替代指標,請根據實(shí)驗重要性原則來(lái)取舍檢測指標,比如是磷酸化的指標會(huì )比表面的指標更為重要。雖然這一段看起來(lái)有一點(diǎn)像“廢話(huà)”,但我們需要在實(shí)際實(shí)驗過(guò)程中學(xué)會(huì )做取舍和判斷。

    4. 結語(yǔ)
    流式實(shí)驗中會(huì )碰到很多有意思的問(wèn)題,小達君后續會(huì )慢慢進(jìn)行整理,并和大家做分享交流,也希望大家多與我們分享寶貴的經(jīng)驗,共同提高!
    參考文獻
    • Cossarizza A, Chang HD, Radbruch A, et al.Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunologicalstudies. Eur J Immunol. 2017 Oct; 47(10):1584-1797.

    • Li N, Hallde?n G, Hjemdahl P. A whole-blood flow cytometric assay for leukocyte CD11b expression using fluorescencesignal triggering. Eur J Haematol. 2000: 65:57±65.

    • Judith C. Stewart, Michelle L. Villasmil andMark W. Frampton. Changes in Fluorescence Intensity of Selected LeukocyteSurface Markers Following Fixation. Cytometry A. 2007 Jun;71(6):379-85.

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