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    Part8—Denovo FCS Express 6 細胞周期的流式數據分析

    作者:admin信息來(lái)源:達科為日期:2018年01月31日打印字體:  
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    Denovo的微信推文已經(jīng)陪伴大家走過(guò)了7期的內容,想必大家已經(jīng)被Denovo強大的流式數據分析功能徹底圈粉了吧!前面7期的內容主要介紹了Denovo軟件的安裝,流式數據分析的入門(mén)篇,流式數據的批量處理,多色分析及流式凋亡數據分析。那么本期內容更厲害了呢!在本期內容中小達君將給大家奉上細胞周期的流式數據分析的相關(guān)內容。趕快打開(kāi)電腦,搬好小板凳,和小達君一起開(kāi)始實(shí)戰演習吧~

    演示工具:裝有Denovo FCS Express 6的電腦一臺(參考入門(mén)篇的試用裝版本安裝~)

    演示數據:細胞周期的流式數據分析

    演示內容:細胞周期數據的分析,關(guān)于細胞周期各個(gè)參數的調用,統計學(xué)圖表的建立

    1.添加實(shí)驗數據


    參考前面推文可知,在Denovo軟件中添加數據的方式有多種,以下通過(guò)Data list命令按鈕直接添加,具體操作如下: 



    2.數據分析


    將數據添加進(jìn)來(lái)之后,圈門(mén),把目的細胞拖拽出來(lái),單獨分析,首先需要去除粘連細胞,不同的流式細胞儀排除粘連細胞時(shí),用到的參數有時(shí)候不一樣,此處,通過(guò)改變PI通道的參數(分別改成FL2-A及FL2-W)來(lái)去除粘連細胞,具體操作如下圖:



    3.細胞周期的流式數據分析模板建立


    a.粘連細胞去除之后,可直接調用Denovo自帶的細胞周期分析模板,完成數據分析,具體操作如下:



    b.將細胞周期分析的模板調出來(lái)之后,點(diǎn)擊OK,會(huì )彈出如下圖所示的界面,然后可以利用insert按鈕,插入文本框,從而可實(shí)現圖注的編輯,如下圖所示(我們可以對圖中的每個(gè)峰進(jìn)行命名,從而可以對細胞周期中的各個(gè)時(shí)期進(jìn)行命名和解釋?zhuān)?/span>



    4.細胞周期的流式數據分析中相關(guān)參數的調用


    a.在細胞周期分析的模板中,有不同的模板可以調用,用戶(hù)可以根據自己的需要,選擇相應的細胞周期數據分析模型,具體操作如下圖所示:



    b.不同的細胞周期數據分析模型,其分析標準不一樣,Denovo對不同的模型均作了相關(guān)的定義,用戶(hù)可以直接查看,具體操作如下:



    c.當完成細胞周期數據分析后,接上面一步,可以通過(guò)Statistics按鈕,將相關(guān)的參數調出來(lái),具體展示如下:



    5.利用Spreadsheets插入圖表


    (參考Part7的微信推文,里面有詳細的關(guān)于Spreadsheets的使用)

    a.舉例,對細胞周期中G1期,S期及G2期各細胞比列的情況分析并做成柱形圖及餅狀圖,直接插入Spreadsheets,然后將相應的數據拖拽入表格中,點(diǎn)擊insert命令按鈕,插入相應的柱形圖和餅狀圖,操作如下:



    b.同時(shí)通過(guò)Format按鈕可以更改圖形的相關(guān)參數,可以使圖表的排版及色彩布置達到令用戶(hù)滿(mǎn)意的效果,如下圖所示:(具體操作可參見(jiàn)part7-凋亡數據分析的中關(guān)于插入圖表的介紹)



    由于微信的演示空間有限,本期的內容介紹就到此結束,Denovo FCS Express 6還有更多,更好,更強的流式數據分析功能,我們期待和您共同探討,感興趣的可以在下方留言并留下您的聯(lián)系方式,我們技術(shù)部的同事會(huì )和您聯(lián)系~


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